PERBANDINGAN KUALITAS DAN KUANTITAS EKSTRAK DNA Staphylococcus aureus ANTARA AlLKALINE LYSIS DAN KIT BERBASIS FILTER
Jurnal Bio Komplementer Medicine
View Archive InfoField | Value | |
Title |
PERBANDINGAN KUALITAS DAN KUANTITAS EKSTRAK DNA Staphylococcus aureus ANTARA AlLKALINE LYSIS DAN KIT BERBASIS FILTER
|
|
Creator |
Belinda, Dila Prasetya
Fadli, Muhammad Zainul Risandiansyah, Rio |
|
Description |
ABSTRAKPendahuluan: S. aureus merupakan penyebab infeksi nosokomial dan dapat menimbulkan sepsis, sehingga perlu penegakkan diagnosis yang cepat menggunakan metode deteksi berbasis DNA. Ekstraksi DNA yang umum dilakukan adalah berbasis filter (KBF) yang mahal. Alkaline Lysis (AL) merupakan metode ektraksi DNA yang sederhana dan ekonomis, namun tingkat kualitas dan kuantitas ekstrak DNA pada S. aureus masih belum diketahui. Metode: Penelitian eksperimental laboratorium in vitro menggunakan bakteri S. aureus VT003221 untuk mendapatkan ekstrak DNA dengan metode AL dan KBF. Konsentrasi bakteri yang digunakan adalah 108 dan 1012 CFU/ml, dengan NS sebagai kontrol. Hasil ekstrak DNA diuji kualitas dan kuantitas dengan spektrofotometri nanodrop. Data di analisa dan p<0,05 dianggap signifikan.Hasil: Kuantitas ekstrak DNA metode AL pada kontrol, 108 dan 1012 CFU/ml adalah 0,80 ± 0,44, 3,80 ± 0,83, dan 14,20 ± 3,34 µg/ml dengan kualitas -0,29 ± 0,05, 1,49 ± 0,16, 1,97 ± 0,06 (p<0,05). Sedangkan KBF pada kontrol, 108 dan 1012 CFU/ml kuantitasnya 0, 5,20 ± 1,78, dan 35,40 ± 12,46 µg/ml dengan kualitas 0, 2,00 ± 0, 1,84 ± 0,02. Hasil kualitas dari kedua metode baik karena berada pada rentang nilai 1.8 – 2.0, namun kurang baik pada konsentrasi 108 CFU/ml dari metode AL, sedangkan dari kuantitasnya metode KBF lebih tinggi dibandingkan AL. Hal ini diduga terjadi karena KBF lebih detail dibandingkan dengan AL.Kesimpulan: Metode Kit Berbasis Filter menghasilkan ekstrak DNA yang lebih baik secara kualitas dan kuantitas dibandingkan AL dalam mengestraksi DNA s. aureus Kata Kunci: Ekstraksi DNA, Staphylococcus aureus, Alkaline Lysis, Kit Berbasis Filter
|
|
Publisher |
Jurnal Bio Komplementer Medicine
|
|
Contributor |
—
|
|
Date |
2021-11-30
|
|
Type |
info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion Peer-reviewed Article |
|
Format |
application/pdf
|
|
Identifier |
http://riset.unisma.ac.id/index.php/jbm/article/view/14006
|
|
Source |
Jurnal Bio Komplementer Medicine; Vol 8, No 2 (2021)
|
|
Language |
eng
|
|
Relation |
http://riset.unisma.ac.id/index.php/jbm/article/view/14006/10770
|
|
Rights |
Copyright (c) 2021 Jurnal Bio Komplementer Medicine
|
|